28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0114 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  30.77 
 
 
299 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  32.33 
 
 
260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  28.17 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  29.64 
 
 
295 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  29.37 
 
 
289 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  28.27 
 
 
292 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  28.57 
 
 
301 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  26.76 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  28.17 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  26.37 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  27.21 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  24.7 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  25.27 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  25.88 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2518  hypothetical protein  26.92 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1407  hypothetical protein  26.44 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2571  hypothetical protein  26.44 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3181  hypothetical protein  26.44 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2133  hypothetical protein  26.44 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2658  hypothetical protein  26.44 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  25.78 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  26.52 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1960  hypothetical protein  25.1 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  26.21 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  30.67 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  29.29 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>