21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1480 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  554  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  28.78 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  37.09 
 
 
299 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  29.26 
 
 
295 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  27.88 
 
 
289 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  29.5 
 
 
282 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  33.09 
 
 
343 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  24.16 
 
 
303 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  26.71 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  26.02 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  31.46 
 
 
338 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  26.59 
 
 
304 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  24.3 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  32.12 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  27.11 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  26.62 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  30.99 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  25.27 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  24.56 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  22.31 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  30.77 
 
 
563 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>