30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1199 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  100 
 
 
289 aa  593  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  71.63 
 
 
295 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  41.51 
 
 
303 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  39.25 
 
 
300 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  39.73 
 
 
292 aa  198  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  40.07 
 
 
301 aa  195  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  39.1 
 
 
296 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  35.85 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  33.58 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  32.08 
 
 
282 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  32.58 
 
 
338 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  30 
 
 
304 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  27.88 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  28.01 
 
 
299 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  27.31 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  28.02 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  29.28 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  30.46 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0674  hypothetical protein  26.34 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.130919  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  24.48 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2518  hypothetical protein  26.02 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  31.01 
 
 
563 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1407  hypothetical protein  26.02 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2571  hypothetical protein  26.02 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3181  hypothetical protein  26.02 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2133  hypothetical protein  26.02 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2658  hypothetical protein  26.02 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1960  hypothetical protein  26.53 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  28.22 
 
 
423 aa  49.3  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>