29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1205 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  100 
 
 
303 aa  613  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  56.9 
 
 
301 aa  358  6e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  52.79 
 
 
296 aa  305  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  49.32 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  41.79 
 
 
286 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  41.51 
 
 
289 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  39.41 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  34.62 
 
 
304 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  33.09 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  35.69 
 
 
292 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  32.61 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  28.28 
 
 
299 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  32.71 
 
 
282 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  30.39 
 
 
345 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  28.99 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  24.16 
 
 
281 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  26.21 
 
 
260 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  28.17 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0674  hypothetical protein  27.07 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.130919  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  28.78 
 
 
308 aa  79  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  30.73 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1407  hypothetical protein  21.81 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2571  hypothetical protein  21.81 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3181  hypothetical protein  21.81 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2658  hypothetical protein  21.81 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2518  hypothetical protein  21.99 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2133  hypothetical protein  22.11 
 
 
239 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1960  hypothetical protein  21.81 
 
 
259 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47780  predicted protein  25.23 
 
 
716 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>