31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1358 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  100 
 
 
296 aa  608  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  56.83 
 
 
301 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  52.79 
 
 
303 aa  305  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  46.38 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  41.7 
 
 
286 aa  208  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  38.11 
 
 
289 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  37.19 
 
 
295 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  33.79 
 
 
338 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  34.68 
 
 
304 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  34.27 
 
 
343 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  35.17 
 
 
292 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  33.21 
 
 
282 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  30.99 
 
 
284 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  33.78 
 
 
345 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  29.6 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  29.46 
 
 
260 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  26.71 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  27.21 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0674  hypothetical protein  28.31 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.130919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  29 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  24.74 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1407  hypothetical protein  25.81 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2571  hypothetical protein  25.81 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2518  hypothetical protein  25.81 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3181  hypothetical protein  25.81 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2133  hypothetical protein  25.81 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2658  hypothetical protein  25.81 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1960  hypothetical protein  25.27 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47780  predicted protein  23.35 
 
 
716 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  27.97 
 
 
1213 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  22.67 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>