21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  712    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  39.72 
 
 
284 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  37.81 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  37.32 
 
 
282 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  35.74 
 
 
338 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  32.86 
 
 
300 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  33.92 
 
 
296 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  30.39 
 
 
303 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  32.01 
 
 
299 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  34.65 
 
 
292 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  30 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  27.97 
 
 
301 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  32.17 
 
 
260 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  30.58 
 
 
286 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  26.22 
 
 
304 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  29.67 
 
 
295 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  29.28 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  26.62 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  26.52 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  27.64 
 
 
267 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0674  hypothetical protein  23.37 
 
 
304 aa  50.1  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.130919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>