16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00840 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  852    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1213 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  26.21 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  29.95 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00980  hypothetical protein  55.26 
 
 		 38 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  28.91 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  28.81 
 
 		 260 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  28.22 
 
 		 289 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  23.5 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  27.8 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  23.64 
 
 		 301 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  27.5 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  25.34 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  24.21 
 
 		 282 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  25.87 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  22.67 
 
 		 296 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>