51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1841 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  99.73 
 
 
412 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  718    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  99.73 
 
 
412 aa  716    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  71.35 
 
 
372 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  71.07 
 
 
381 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  65.17 
 
 
358 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  53.05 
 
 
399 aa  352  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  58.11 
 
 
399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  56.58 
 
 
383 aa  338  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  51.65 
 
 
382 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  48.45 
 
 
416 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  41.91 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  39.19 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  39.24 
 
 
400 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  36.34 
 
 
428 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  38.04 
 
 
422 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  36.44 
 
 
396 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  35.07 
 
 
385 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  34.01 
 
 
392 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  35.26 
 
 
407 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  35.56 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  36.04 
 
 
438 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  36.46 
 
 
418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  33.72 
 
 
412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  37.64 
 
 
428 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  34.78 
 
 
414 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  34.82 
 
 
423 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  36.34 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  33.62 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  35.14 
 
 
415 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  33.92 
 
 
400 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.3 
 
 
402 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  36.1 
 
 
411 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  33.95 
 
 
443 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  26.07 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  26.1 
 
 
444 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  25.41 
 
 
419 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  32.88 
 
 
487 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  30.45 
 
 
477 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  30.15 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  25.68 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  23.21 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  21.71 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  25 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  20.23 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  20.98 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  20.99 
 
 
399 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  22.19 
 
 
394 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  27.59 
 
 
474 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  24 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>