30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2859 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  44.42 
 
 
884 aa  722    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 
854 aa  1760    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  40.5 
 
 
872 aa  638    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  43.67 
 
 
863 aa  706    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  40.9 
 
 
881 aa  636    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  38.11 
 
 
868 aa  558  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  38.71 
 
 
812 aa  491  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  32.93 
 
 
815 aa  427  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  28.05 
 
 
840 aa  332  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  30.24 
 
 
808 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.78 
 
 
891 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.06 
 
 
837 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.21 
 
 
840 aa  272  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.37 
 
 
824 aa  268  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.21 
 
 
961 aa  214  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  27.26 
 
 
998 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.08 
 
 
1045 aa  187  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  24.51 
 
 
836 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.1 
 
 
1030 aa  179  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  22.4 
 
 
768 aa  144  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.67 
 
 
1048 aa  114  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  34.32 
 
 
736 aa  90.9  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.72 
 
 
2073 aa  88.6  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  37.18 
 
 
704 aa  82  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0967  uncharacterized membrane protein required for N-linked glycosylation-like protein  45.12 
 
 
83 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.152221 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  20.53 
 
 
743 aa  64.7  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01455  hypothetical protein similar to oligosaccharyl transferase (Eurofung)  21.74 
 
 
741 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.531962 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82607  oligosaccharyl transferase subunit  22.76 
 
 
745 aa  59.3  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.214118  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1479  hypothetical protein  28.99 
 
 
774 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.202348  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01850  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 
815 aa  45.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>