24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2412 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 		 474 aa  972    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  63.66 
 
 		 465 aa  643    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  60.99 
 
 		 467 aa  627  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  63.52 
 
 		 467 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  52.65 
 
 		 471 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  48.6 
 
 		 674 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  40.29 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  46.94 
 
 		 527 aa  363  4e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  44.58 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  46.08 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  43.75 
 
 		 588 aa  344  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  40.35 
 
 		 594 aa  324  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  37.55 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  41.38 
 
 		 584 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  41.13 
 
 		 578 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  40.89 
 
 		 583 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  39.51 
 
 		 640 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  34.47 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  24.79 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  22.96 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2925  metallophosphoesterase  26.06 
 
 		 275 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  23.46 
 
 		 280 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>