33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0522 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  79.49 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  79.49 
 
 
124 aa  197  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  78.63 
 
 
124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  71.55 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  54.17 
 
 
129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  51.28 
 
 
139 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  50.42 
 
 
131 aa  120  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  46.22 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  46.22 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  51.79 
 
 
131 aa  107  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  43.7 
 
 
132 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  39.5 
 
 
130 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  45.05 
 
 
135 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  44.54 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  37.82 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  48.74 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  43.33 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  40.5 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  40.34 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  40.34 
 
 
135 aa  94.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  50 
 
 
214 aa  90.9  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  46.94 
 
 
212 aa  84  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  41.67 
 
 
148 aa  84  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  42.24 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  40.52 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  38.33 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  37.5 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  34.19 
 
 
245 aa  67.8  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  32.23 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  32.2 
 
 
237 aa  54.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  30.77 
 
 
237 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7099  predicted protein  33.61 
 
 
236 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.360457  normal  0.295389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>