More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2112 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  100 
 
 
324 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  74.69 
 
 
324 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  73.15 
 
 
324 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  73.57 
 
 
324 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  71.6 
 
 
338 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  71.25 
 
 
324 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  71.25 
 
 
324 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  72.84 
 
 
324 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  68.77 
 
 
324 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  68.81 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  68.54 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  68.63 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  68.45 
 
 
324 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  68.45 
 
 
324 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  68.55 
 
 
317 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  68.5 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  67.31 
 
 
321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  68.17 
 
 
334 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  67.3 
 
 
314 aa  441  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  67.31 
 
 
321 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  66.88 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  66.56 
 
 
321 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  66.34 
 
 
321 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  66.25 
 
 
321 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  66.56 
 
 
321 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  65 
 
 
321 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  64.89 
 
 
335 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  64.76 
 
 
320 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  64.94 
 
 
345 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  61.59 
 
 
313 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  61.86 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  61.39 
 
 
332 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  61.86 
 
 
317 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  62.1 
 
 
314 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  60.06 
 
 
323 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  58.6 
 
 
331 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  61.86 
 
 
312 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  60.06 
 
 
361 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  61.66 
 
 
320 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  61.66 
 
 
346 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  58.2 
 
 
314 aa  391  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  61.04 
 
 
346 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  59.62 
 
 
319 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  59.49 
 
 
322 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  60.74 
 
 
320 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  59.25 
 
 
321 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  61.04 
 
 
320 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  61.04 
 
 
320 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  61.04 
 
 
320 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  60.99 
 
 
316 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  58.9 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  58.9 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  59.38 
 
 
317 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  58.9 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  60.38 
 
 
323 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  58.9 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  59.2 
 
 
320 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  60.38 
 
 
323 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  58.9 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  58.9 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  58.9 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  59.33 
 
 
321 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  57.32 
 
 
320 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  58.13 
 
 
316 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  57.32 
 
 
320 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  58.93 
 
 
317 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  56.7 
 
 
316 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  57.81 
 
 
320 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  59.75 
 
 
333 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  59.01 
 
 
319 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  60.06 
 
 
333 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  57.37 
 
 
321 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  58.95 
 
 
316 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  56.7 
 
 
316 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  57.37 
 
 
321 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  57.41 
 
 
314 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  58.02 
 
 
316 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  57.68 
 
 
352 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  58.44 
 
 
317 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  58.51 
 
 
333 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  57.41 
 
 
318 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  58.33 
 
 
318 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  56.66 
 
 
317 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  59.63 
 
 
316 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  56.66 
 
 
317 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  59.63 
 
 
316 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  57.41 
 
 
318 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  57.05 
 
 
316 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  57.89 
 
 
318 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  58.36 
 
 
317 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  58.13 
 
 
319 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  58.7 
 
 
320 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  59.31 
 
 
315 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  57.81 
 
 
318 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  59.81 
 
 
317 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  57.81 
 
 
323 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  58.36 
 
 
317 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  56.78 
 
 
316 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  56.7 
 
 
337 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  58.07 
 
 
318 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>