More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1071 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
167 aa  333  9e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  76.05 
 
 
167 aa  263  8.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  77.64 
 
 
161 aa  254  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.52 
 
 
167 aa  229  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.12 
 
 
161 aa  220  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.67 
 
 
167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  63.64 
 
 
169 aa  209  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  64.02 
 
 
170 aa  208  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.15 
 
 
161 aa  208  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  61.82 
 
 
170 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.38 
 
 
172 aa  203  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.37 
 
 
170 aa  202  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  61.11 
 
 
164 aa  202  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  62.73 
 
 
160 aa  200  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  58.86 
 
 
166 aa  198  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  55.56 
 
 
165 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  62.73 
 
 
172 aa  195  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  62.73 
 
 
172 aa  195  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  58.23 
 
 
161 aa  187  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.25 
 
 
163 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.49 
 
 
178 aa  185  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.83 
 
 
171 aa  184  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.06 
 
 
175 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
169 aa  183  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.61 
 
 
169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.21 
 
 
174 aa  181  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  53.99 
 
 
174 aa  181  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.06 
 
 
172 aa  181  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.76 
 
 
163 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.06 
 
 
182 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  55.62 
 
 
161 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.76 
 
 
163 aa  178  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.44 
 
 
169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.52 
 
 
163 aa  177  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.96 
 
 
163 aa  177  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.13 
 
 
164 aa  177  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  53.42 
 
 
167 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  55.35 
 
 
165 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.15 
 
 
172 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  52.15 
 
 
174 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  55.48 
 
 
172 aa  174  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  51.28 
 
 
185 aa  173  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  55.48 
 
 
159 aa  173  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.8 
 
 
172 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.8 
 
 
172 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.77 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  55.9 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.78 
 
 
176 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.78 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.28 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 
161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.6 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
167 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
167 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.28 
 
 
163 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.9 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.9 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.9 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.96 
 
 
168 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  55.97 
 
 
166 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
176 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.77 
 
 
162 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.04 
 
 
165 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.17 
 
 
178 aa  168  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.199975  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  52.83 
 
 
162 aa  168  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
174 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_736  acetolactate synthase, small subunit  54.91 
 
 
178 aa  168  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  51.2 
 
 
175 aa  168  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  48.19 
 
 
170 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
174 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
174 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.92 
 
 
174 aa  167  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.6 
 
 
168 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2144  acetolactate synthase, small subunit  51.55 
 
 
170 aa  167  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0207979  normal  0.0119261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.4 
 
 
168 aa  167  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  50.92 
 
 
207 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.3 
 
 
171 aa  166  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
176 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.23 
 
 
169 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1556  acetolactate synthase, small subunit  50.93 
 
 
180 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08540  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.31 
 
 
169 aa  165  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.097945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1967  acetolactate synthase, small subunit  50.31 
 
 
180 aa  164  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13211  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.78 
 
 
174 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.463823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
184 aa  164  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.06 
 
 
162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.84 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  53.21 
 
 
168 aa  163  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  51.52 
 
 
172 aa  163  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1241  acetolactate synthase, small subunit  49.69 
 
 
179 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  49.69 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  47.2 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.77 
 
 
166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502745  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1202  acetolactate synthase, small subunit  52.26 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  44.31 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.5 
 
 
163 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>