65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3090 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  99.69 
 
 		 326 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  91.1 
 
 		 323 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  75 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  75.42 
 
 		 317 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  71.38 
 
 		 316 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  52.84 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  56.01 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  47.33 
 
 		 314 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  46.96 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  44.18 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  44.18 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  42.81 
 
 		 347 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  41.64 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  41.19 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  43.23 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  45.61 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  47.97 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  46.96 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  41.02 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  44.59 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  44.48 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  45.99 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  44.09 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  35.42 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  38.74 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  35.66 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  37.67 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.16 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  42.13 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  36.28 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  35.75 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  34.54 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  34.54 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  31.69 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  36.19 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  30.07 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  30.67 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  25.99 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  26.64 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  27.69 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  24.68 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  26.75 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  29.08 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  28.98 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  30.87 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  27.76 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  24.32 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  27.01 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.27 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  24.53 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  27.01 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.27 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  24.36 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  24.36 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.36 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  24.36 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  24.36 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.27 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.27 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002140  cell division protein FtsX  25.81 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000746474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>