More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2874 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  100 
 
 
273 aa  568  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  67.29 
 
 
273 aa  374  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
274 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 
274 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  31.2 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
269 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  37.24 
 
 
269 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
246 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  26.32 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
276 aa  79  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.11 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.44 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.11 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.65 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
284 aa  72  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.86 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.09 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.96 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.45 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.96 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.9 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.95 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.96 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.09 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.58 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2940  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  26.67 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.08 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.18 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.22 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.57 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.19 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  25.37 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.37 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.26 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.07 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.62 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.09 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.27 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.21 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  32.62 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.42 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.86 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.85 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  34.33 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.25 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  23.26 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.85 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.57 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
411 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.88 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>