More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1778 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  100 
 
 
629 aa  1264    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.52 
 
 
789 aa  435  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.52 
 
 
586 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  41.27 
 
 
750 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  41.78 
 
 
622 aa  413  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.29 
 
 
606 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.41 
 
 
628 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  40.62 
 
 
625 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.99 
 
 
635 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.27 
 
 
810 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  40.65 
 
 
649 aa  402  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.58 
 
 
595 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  37.89 
 
 
630 aa  392  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.95 
 
 
590 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  37.33 
 
 
586 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.41 
 
 
626 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41 
 
 
624 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.93 
 
 
613 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  36.86 
 
 
586 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  41.71 
 
 
623 aa  389  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.37 
 
 
590 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.9 
 
 
600 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  39.83 
 
 
623 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.41 
 
 
616 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.29 
 
 
590 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.41 
 
 
616 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  38.28 
 
 
603 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  38.57 
 
 
731 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  38.08 
 
 
632 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  42.03 
 
 
604 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  43.17 
 
 
639 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.86 
 
 
752 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  39.71 
 
 
654 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.61 
 
 
592 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  41.11 
 
 
642 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.16 
 
 
631 aa  379  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.6 
 
 
591 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.7 
 
 
624 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.49 
 
 
592 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  41.01 
 
 
745 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.43 
 
 
606 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.54 
 
 
583 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.37 
 
 
593 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.61 
 
 
589 aa  369  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.35 
 
 
585 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.62 
 
 
624 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  41.7 
 
 
605 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  42.22 
 
 
604 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.09 
 
 
591 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.72 
 
 
608 aa  364  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.1 
 
 
595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.1 
 
 
595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.1 
 
 
595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  38.47 
 
 
577 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.79 
 
 
563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.03 
 
 
567 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
565 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.86 
 
 
567 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
565 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
565 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.86 
 
 
567 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  38.14 
 
 
565 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.69 
 
 
567 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.69 
 
 
567 aa  356  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  36.81 
 
 
626 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.97 
 
 
565 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.42 
 
 
583 aa  353  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.63 
 
 
561 aa  353  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  41.14 
 
 
608 aa  353  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.87 
 
 
565 aa  353  7e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  37.8 
 
 
565 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.36 
 
 
610 aa  350  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  37.85 
 
 
623 aa  350  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.02 
 
 
565 aa  349  8e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.66 
 
 
613 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.66 
 
 
613 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.31 
 
 
563 aa  347  5e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.11 
 
 
613 aa  346  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.66 
 
 
610 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.92 
 
 
602 aa  345  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.34 
 
 
611 aa  342  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  36 
 
 
631 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.96 
 
 
619 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  33.9 
 
 
577 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.86 
 
 
619 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  34.86 
 
 
570 aa  340  4e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  34.47 
 
 
575 aa  340  4e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.02 
 
 
604 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.01 
 
 
619 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.86 
 
 
619 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  36.9 
 
 
618 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.47 
 
 
616 aa  334  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.98 
 
 
612 aa  333  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.91 
 
 
572 aa  332  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  36.12 
 
 
611 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  39.05 
 
 
603 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.67 
 
 
654 aa  330  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  36.8 
 
 
610 aa  329  9e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.61 
 
 
609 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>