More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1705 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  100 
 
 		 96 aa  188  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 		 96 aa  147  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 		 96 aa  147  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 95 aa  146  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 		 96 aa  144  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  70.53 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 96 aa  141  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  68.09 
 
 		 106 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 		 96 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 		 96 aa  127  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  60.42 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  60.42 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 105 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 105 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 105 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  63.16 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  61.86 
 
 		 97 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 104 aa  123  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  61.86 
 
 		 97 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 97 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  60.42 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 98 aa  120  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  54.17 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  54.17 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  54.17 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  57.45 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1692  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0464851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>