More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1692 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1692  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  185  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0464851  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1622  co-chaperonin GroES  95.79 
 
 		 95 aa  180  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3627  co-chaperonin GroES  87.37 
 
 		 95 aa  170  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03704  co-chaperonin GroES  86.32 
 
 		 95 aa  168  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  60 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  59.57 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  54.26 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 105 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 94 aa  106  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 96 aa  105  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  46.81 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  46.81 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  46.81 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0345  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  45.74 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  45.74 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  45.74 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  45.74 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  50.53 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  50 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  50 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>