40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0075 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  100 
 
 		 336 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  38.26 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  33.33 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  31.58 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  38.38 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  26.13 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  30.04 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  29.6 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  29.6 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  29.6 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  29.26 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  29.26 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  29.26 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  29.26 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  29.6 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  29.15 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  27.51 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  36.13 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  28.49 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  25.6 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  33.1 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  25.6 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  34.34 
 
 		 758 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5235  lipase, class 3  40.4 
 
 		 208 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  27.74 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  34.01 
 
 		 539 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5096  lipase class 3  28.76 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000321427  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  29.52 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  33.1 
 
 		 727 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  28.57 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  29.45 
 
 		 726 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  35.24 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  27.01 
 
 		 271 aa  46.2  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  28.66 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  30.51 
 
 		 641 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29272  predicted protein  36.67 
 
 		 550 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  30.56 
 
 		 266 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.92 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  25.29 
 
 		 216 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>