17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5235 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5235  lipase, class 3  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  40.4 
 
 
336 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  31.25 
 
 
357 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  29.45 
 
 
276 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  30.3 
 
 
294 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  35.77 
 
 
324 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  30.6 
 
 
378 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  31.36 
 
 
299 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  28.67 
 
 
726 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  31.25 
 
 
404 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  29.27 
 
 
758 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  31.13 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  30.77 
 
 
539 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  30.11 
 
 
727 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3866  hypothetical protein  34.85 
 
 
310 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595881  normal  0.582727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  27.54 
 
 
387 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  27.54 
 
 
387 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>