More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf369 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf369  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
88 aa  176  1e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000790413  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0142  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
91 aa  90.9  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000446428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
95 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  45.98 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  44.32 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  43.02 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  44.19 
 
 
95 aa  77  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  41.86 
 
 
95 aa  77  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  40.7 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  46.25 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  46.25 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  43.04 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  42.53 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  42.05 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  45 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  43.68 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  42.53 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0195  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.10156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  42.53 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  36.78 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  42.53 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  42.53 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  44.32 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  44.71 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  44.44 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  45 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  43.68 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  46.84 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  43.53 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  43.21 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  43.53 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  42.53 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  37.93 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  42.05 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  43.53 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  36.78 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  40.51 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  40.7 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  36.78 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  37.93 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  37.93 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1168  ribosomal protein S15  43.21 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  39.08 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0073  30S ribosomal protein S15  38.64 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1398  SSU ribosomal protein S15P  41.38 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  40.91 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  42.53 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2190  30S ribosomal protein S15  38.64 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000000960154  normal  0.597988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  39.77 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  39.08 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  42.53 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  39.08 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  46.84 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  41.77 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  44.3 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  37.5 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  40.23 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  39.08 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  41.98 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  36.78 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  41.38 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  43.75 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  38.64 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>