More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2190 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2190  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000000960154  normal  0.597988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  53.66 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  51.81 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  53.01 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  56.63 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
88 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  57.32 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  52.44 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  53.01 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  87  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  53.75 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  53.75 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  53.75 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  53.75 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  53.75 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  53.66 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  52.5 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  52.5 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  52.5 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  52.5 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  52.5 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  51.22 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  84.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  52.5 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  52.5 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  52.5 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  51.22 
 
 
89 aa  85.5  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  47.62 
 
 
89 aa  84.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  51.22 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  52.44 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  52.5 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  50 
 
 
87 aa  84  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  55.56 
 
 
89 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 
89 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  51.22 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  50 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1168  ribosomal protein S15  49.4 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  50 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  50 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  51.19 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  51.19 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  49.4 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  52.44 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  50.6 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  51.85 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  48.81 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  49.41 
 
 
87 aa  80.1  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  48.19 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  48.84 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  48.19 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  46.99 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  47.56 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  47.62 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  47.56 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  46.99 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  46.99 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  48.78 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  46.34 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>