More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0180 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
602 aa  1207    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  51.17 
 
 
593 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  50.33 
 
 
630 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  50.62 
 
 
627 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  50.26 
 
 
644 aa  551  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  49.48 
 
 
661 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 
658 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  44.17 
 
 
641 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  38.06 
 
 
760 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  38.12 
 
 
719 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  38.73 
 
 
763 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 
775 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  39.82 
 
 
599 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  40.9 
 
 
775 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
626 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
763 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  38.15 
 
 
765 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  38.15 
 
 
764 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  38.88 
 
 
621 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 
737 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  41.06 
 
 
776 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  38.59 
 
 
618 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  38.88 
 
 
764 aa  382  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  41.23 
 
 
611 aa  382  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
763 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  42.99 
 
 
774 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
763 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  42.99 
 
 
774 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  42.99 
 
 
774 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  40.69 
 
 
802 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  38.74 
 
 
780 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  40.33 
 
 
626 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
763 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  42.6 
 
 
743 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  36.27 
 
 
616 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  38.08 
 
 
759 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 
654 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  39.04 
 
 
791 aa  343  5.999999999999999e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
629 aa  339  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
646 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  33.1 
 
 
783 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.21 
 
 
818 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
646 aa  323  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  33.69 
 
 
630 aa  323  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  34.65 
 
 
640 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 
762 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  39.38 
 
 
794 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  32.98 
 
 
788 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  33.16 
 
 
788 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
654 aa  313  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
889 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  34 
 
 
850 aa  313  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  36.94 
 
 
715 aa  313  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
734 aa  312  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  32.81 
 
 
788 aa  312  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  32.98 
 
 
788 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
889 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  34.27 
 
 
651 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  32.3 
 
 
851 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  32.72 
 
 
786 aa  311  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.62 
 
 
794 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.36 
 
 
894 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  32.08 
 
 
737 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  32.81 
 
 
788 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
656 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  32.51 
 
 
788 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  32.51 
 
 
788 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  32.41 
 
 
788 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  32.41 
 
 
788 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  31.34 
 
 
699 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2304  heavy metal translocating P-type ATPase  32.41 
 
 
686 aa  307  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  33.86 
 
 
712 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  36.21 
 
 
744 aa  306  7e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
869 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  34.45 
 
 
656 aa  306  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
851 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5743  heavy metal translocating P-type ATPase  35.08 
 
 
655 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  32.86 
 
 
735 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  34.68 
 
 
852 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  33.45 
 
 
822 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  34.64 
 
 
710 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3681  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
710 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  34.64 
 
 
710 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  33.88 
 
 
641 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  31.72 
 
 
785 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  30.94 
 
 
785 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
851 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  31.2 
 
 
639 aa  303  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  34.94 
 
 
641 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  31.76 
 
 
817 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  31.76 
 
 
817 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  30.9 
 
 
712 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
677 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  32.85 
 
 
826 aa  303  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
712 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 
721 aa  302  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  31.22 
 
 
658 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
870 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  34.57 
 
 
641 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  33.39 
 
 
641 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>