75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2392 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  868    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  56.08 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  54.28 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  55.21 
 
 		 409 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  55.45 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  54.95 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  53.16 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  54.09 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  53.57 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  53.16 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  53.57 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  53.32 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  50.37 
 
 		 420 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  50.36 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  45.82 
 
 		 413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  34.68 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  36.02 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  31.78 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  30.95 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  35.96 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  38.05 
 
 		 612 aa  186  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  32.61 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  32.31 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  33.89 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  33.89 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  30.65 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  33.14 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  32.32 
 
 		 376 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  28.01 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  32.75 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  28.06 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  33.86 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  33.86 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  32.95 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  33.46 
 
 		 283 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  33.59 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  32.8 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  33.59 
 
 		 303 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  32.14 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  33.21 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  32.52 
 
 		 290 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  33.46 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  31.03 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  31.73 
 
 		 273 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  32.82 
 
 		 296 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  32.82 
 
 		 296 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  32.48 
 
 		 277 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  31.1 
 
 		 276 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  32.05 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  33.2 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  31.64 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  30.65 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  31.58 
 
 		 307 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  32.44 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  30.12 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  34.24 
 
 		 277 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  31.01 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  31.01 
 
 		 280 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  30.49 
 
 		 309 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  32.3 
 
 		 298 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  32.3 
 
 		 278 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  29.72 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49556  predicted protein  28.98 
 
 		 541 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  26.67 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>