29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0062 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  100 
 
 		 73 aa  146  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  54.17 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  65.08 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  65.08 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  56.16 
 
 		 72 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  52.11 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  52.38 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  50.75 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  56.25 
 
 		 74 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  50.75 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  50.75 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  50 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  58.21 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  40 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  43.94 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  33.8 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  33.8 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  38.71 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  35 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  35.29 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  41.79 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  35.48 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1218  SlyX  36.11 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0838  SlyX family protein  38.89 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000331079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  38.81 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  36.51 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  33.33 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  29.85 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  38.46 
 
 		 69 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>