79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1670 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  100 
 
 		 292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  36.56 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  36.92 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  36.56 
 
 		 282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  34.3 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  32.5 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  34.04 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  31.65 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  32.13 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  29.58 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  32.26 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  32.26 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  32.01 
 
 		 278 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  32.12 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  29.75 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  29.75 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  30.82 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  32.13 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  29.39 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  29.39 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  29.39 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  29.39 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  32.5 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  32.17 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  28.82 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  32.14 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  31.05 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  28.99 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  28.99 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  29.33 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  31.79 
 
 		 277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  31.05 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  27.92 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  28.98 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  31.65 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  29.71 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  28.67 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  25.63 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  27.37 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  29.03 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  27.37 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  27.01 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  27.37 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  27.37 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  24.91 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  27.01 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  27.01 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  26.64 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  28.72 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  26.64 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  26.64 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  28.67 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  26.71 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  26.64 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  29.96 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  26.28 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  26.52 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  29.93 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  24.46 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  25.89 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  30.95 
 
 		 164 aa  92.4  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  25.8 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  27.76 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  27.76 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  22.38 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  25.08 
 
 		 741 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  23.41 
 
 		 646 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  23.41 
 
 		 646 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  23.41 
 
 		 646 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  23.41 
 
 		 646 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  24.52 
 
 		 646 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  23.41 
 
 		 646 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  25.64 
 
 		 892 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  22.93 
 
 		 646 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  22.93 
 
 		 643 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.87 
 
 		 661 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  23.41 
 
 		 646 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  22.93 
 
 		 646 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  23.44 
 
 		 705 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>