67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0341 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  100 
 
 		 304 aa  611  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  32.49 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  27.53 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  29.97 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  27.08 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  30.07 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  28.97 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  25.71 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  28.01 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  28.12 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  26.07 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  25.36 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  29.93 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  26.46 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  27.59 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  27.43 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  24.4 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  24.22 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  26.9 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  25 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  25 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  25 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  25 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  25 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  26.37 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  27.7 
 
 		 282 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  27.27 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  24.91 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  23.45 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  24.22 
 
 		 279 aa  96.7  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  26.06 
 
 		 276 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  24.13 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  24.74 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  24.47 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  25.86 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  25.44 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  25.44 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  25.44 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  24.91 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  25.26 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  23.51 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  25.09 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  26.04 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  27.68 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  24.48 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  24.74 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  24.74 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  24.74 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  24.74 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  24.74 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  25.69 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  23.57 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  25.35 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  25.17 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  25.27 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  22.66 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  29.33 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  21.55 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  26.39 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  26.13 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  23.59 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  22.38 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  22.38 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  24.24 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.16 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  25.65 
 
 		 741 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>