297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0042 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0042  MFS superfamily sulfate permease  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  34.47 
 
 
594 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  33.33 
 
 
604 aa  131  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  31.44 
 
 
554 aa  85.9  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  27.46 
 
 
545 aa  85.1  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  26.8 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  25.39 
 
 
560 aa  82.8  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  25.12 
 
 
558 aa  79.7  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  28.71 
 
 
553 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  26.26 
 
 
568 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  27.45 
 
 
556 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  27.23 
 
 
585 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  27.14 
 
 
581 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  26.37 
 
 
553 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  28.57 
 
 
590 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  28.14 
 
 
552 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  26.26 
 
 
606 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  25.62 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  26.02 
 
 
570 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  26.24 
 
 
580 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  25 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  28.57 
 
 
590 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  27.8 
 
 
590 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  25.13 
 
 
567 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  26.73 
 
 
574 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  24.46 
 
 
546 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  25.74 
 
 
568 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  25.63 
 
 
575 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  22.61 
 
 
553 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  28.29 
 
 
587 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  26.37 
 
 
573 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  24.88 
 
 
551 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  28.12 
 
 
552 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  26.24 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2342  putative sulfate transporter YchM  27.78 
 
 
560 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  25.49 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  25.49 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  25.49 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  27.75 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  23.44 
 
 
536 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  26.6 
 
 
588 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  21.39 
 
 
563 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  24.62 
 
 
552 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  23.38 
 
 
568 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  24.26 
 
 
565 aa  64.7  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  24.38 
 
 
570 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  26.02 
 
 
560 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  26.87 
 
 
563 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  25 
 
 
556 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1540  putative sulfate transporter YchM  25.87 
 
 
561 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0985805  normal  0.161381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  21.26 
 
 
509 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1356  putative sulfate transporter YchM  25.87 
 
 
561 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0275368  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1914  putative sulfate transporter YchM  25.87 
 
 
561 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.200297  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1920  putative sulfate transporter YchM  25.87 
 
 
561 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0235525  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  24.88 
 
 
563 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2268  putative sulfate transporter YchM  23.04 
 
 
572 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  27.98 
 
 
573 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1978  putative sulfate transporter YchM  25.87 
 
 
561 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846232  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  30.77 
 
 
555 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  24.12 
 
 
565 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  23.83 
 
 
567 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  27.5 
 
 
551 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  24.12 
 
 
565 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  24.42 
 
 
559 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  26.5 
 
 
551 aa  62  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  20.39 
 
 
626 aa  62  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  21.97 
 
 
586 aa  61.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.16 
 
 
577 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1867  sulphate transporter  22.82 
 
 
557 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0781  sulphate transporter  28.48 
 
 
489 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4401  sulfate transporter  28.48 
 
 
489 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840656  hitchhiker  0.00000000131237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  25 
 
 
572 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  26.34 
 
 
587 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  23.38 
 
 
568 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  27.09 
 
 
552 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  31.52 
 
 
497 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  24.43 
 
 
585 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  25.74 
 
 
605 aa  58.5  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2760  sulphate transporter  23.19 
 
 
607 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.207505 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  27.39 
 
 
541 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1995  putative sulfate transporter YchM  23.62 
 
 
562 aa  58.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  23.56 
 
 
592 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  24.45 
 
 
580 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  23.94 
 
 
558 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01181  predicted transporter  25.13 
 
 
559 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.968457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2441  sulfate transporter  25.13 
 
 
550 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0968  sulfate permease family protein  27.89 
 
 
498 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1353  putative sulfate transporter YchM  25.13 
 
 
550 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000101083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0930  sulfate transporter  26.58 
 
 
489 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  22.84 
 
 
730 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01191  hypothetical protein  25.13 
 
 
559 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.818983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  27.81 
 
 
557 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1311  putative sulfate transporter YchM  25.13 
 
 
550 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000228855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1370  putative sulfate transporter YchM  25.13 
 
 
559 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000347462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1936  putative sulfate transporter YchM  25.13 
 
 
559 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016191  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2420  putative sulfate transporter YchM  25.13 
 
 
550 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.643639  hitchhiker  0.00551985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1687  putative sulfate transporter YchM  25.13 
 
 
559 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000554758  normal  0.520634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  21.88 
 
 
711 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  23.08 
 
 
590 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  23.68 
 
 
565 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>