218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16870  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  100 
 
 
85 aa  157  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.288242  normal  0.471923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0187  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  72.94 
 
 
85 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3185  HPr family phosphocarrier protein  68.24 
 
 
85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0997198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0079  phosphotransferase system, HPr  68.24 
 
 
85 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0088  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.24 
 
 
85 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0093  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  67.06 
 
 
85 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0069  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.24 
 
 
85 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0753  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  67.06 
 
 
85 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4853  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  64.71 
 
 
86 aa  103  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2216  phosphocarrier, HPr family  63.53 
 
 
86 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.081711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07040  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  54.55 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0067  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.933007  normal  0.510342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1539  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00351141  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28580  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  44.83 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00406387  normal  0.0448712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8115  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.98 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2146  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.47 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15370  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  50.57 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363386  normal  0.66532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03520  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  47.13 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.58475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1050  phosphocarrier, HPr family  43.68 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4227  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.2 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0524  phosphocarrier, HPr family  42.86 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2036  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.46 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.67189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1889  HPr family phosphocarrier protein  43.18 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0357203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2174  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.18 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339455  hitchhiker  0.00100115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2487  phosphoryl transfer system, HPr  44.3 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.685989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4007  HPr family phosphocarrier protein  45.65 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0298  HPr family phosphocarrier protein  40.66 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1429  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  43.84 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4027  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.85 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0620705  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.21 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29360  Phosphocarrier protein HPr/PTS system IIA component  40.24 
 
 
231 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.521811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5267  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1269  phosphocarrier, HPr family  46.05 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.034972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1769  phosphocarrier, HPr family protein  37.8 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.95 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0876  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.65 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.45631  normal  0.298141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  33.33 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5261  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.94 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1735  HPrNtr domain-containing protein  40 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1651  phosphocarrier protein HPr  40.24 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  39.02 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7069  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  44.93 
 
 
691 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1641  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0331  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.05 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  31.76 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3201  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2748  phosphocarrier protein HPr  35.06 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4845  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.76 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.778236  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3878  phosphocarrier protein HPr  35.06 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.050969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4116  phosphocarrier protein HPr  33.77 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4180  phosphocarrier protein HPr  33.77 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  39.71 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1215  PTS system HPr component  44.12 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0261  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1818  phosphotransferase system, HPr  35.37 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1923  HPr family phosphocarrier protein  34.52 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1641  phosphocarrier protein (Hpr)  34.52 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1780  phosphocarrier protein HPr  37.66 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0365608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0913  phosphocarrier protein HPr  35.38 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.94 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4112  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  44.78 
 
 
657 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4158  phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00355795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2465  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3959  phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.130103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3790  phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.190201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3805  phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4268  phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2360  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1998  phosphocarrier, HPr family  36.59 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1080  phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2349  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4069  phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.486642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2414  HPr family phosphocarrier protein  36.59 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.700506  hitchhiker  0.00000385306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2562  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  41.25 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236757  normal  0.0371706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2118  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  36.47 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.25 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2238  phosphocarrier protein HPr  35.37 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl565  phosphotransferase system phosphohistidine-containing protein  35 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2214  HPr family phosphocarrier protein  43.28 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.4 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1765  HPr family phosphocarrier protein  35.37 
 
 
85 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.730947  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1843  HPr family phosphocarrier protein  35.37 
 
 
85 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2256  HPr family phosphocarrier protein  35.37 
 
 
85 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.99583  normal  0.188388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1786  phosphocarrier protein HPr  35.38 
 
 
90 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5271  phosphocarrier protein Chr  39.76 
 
 
82 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0669  phosphocarrier protein HPr  31.34 
 
 
88 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.829245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2192  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.37 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0254  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03197  phosphocarrier protein NPR  39.24 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.789521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4945  phosphocarrier protein Chr  38.55 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2878  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.02 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6112  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  44.74 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.334192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  34.18 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.5 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>