More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2174 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2174  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339455  hitchhiker  0.00100115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1539  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  72.09 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00351141  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28580  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  65.52 
 
 
90 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00406387  normal  0.0448712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4227  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.55 
 
 
89 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0524  phosphocarrier, HPr family  53.26 
 
 
92 aa  87  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07040  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  52.27 
 
 
90 aa  84.3  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0298  HPr family phosphocarrier protein  51.09 
 
 
92 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1429  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  56.41 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4027  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.28 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0620705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4007  HPr family phosphocarrier protein  53.26 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0079  phosphotransferase system, HPr  53.41 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0088  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.41 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0069  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.41 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8115  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0067  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.933007  normal  0.510342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0093  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107751 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1269  phosphocarrier, HPr family  45.12 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.034972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0753  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03520  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  55.17 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.58475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5267  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15370  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  47.13 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363386  normal  0.66532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2487  phosphoryl transfer system, HPr  48.72 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.685989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5261  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.75 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4853  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1889  HPr family phosphocarrier protein  43.18 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0357203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3695  phosphocarrier protein Chr  43.37 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.76 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  39.76 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  38.37 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2214  HPr family phosphocarrier protein  47.19 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3201  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.22 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.02 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.25 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3185  HPr family phosphocarrier protein  46.59 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0997198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0187  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.32 
 
 
85 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1951  phosphoryl transfer system HPr  57.58 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000513673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.53 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.24 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4945  phosphocarrier protein Chr  42.17 
 
 
82 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2216  phosphocarrier, HPr family  45.45 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.081711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5271  phosphocarrier protein Chr  42.31 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1050  phosphocarrier, HPr family  41.38 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1091  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.46 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7069  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  49.28 
 
 
691 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1641  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.53 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  33.71 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0882  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.46 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000535519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  35.63 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0866  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.76 
 
 
90 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176719  normal  0.959659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
90 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  34.94 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.35 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01690  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.46 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  40.96 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2138  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.84 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.580759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0103  phosphocarrier protein HPr  35.37 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0536118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5256  phosphocarrier protein Chr  42.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5001  phosphocarrier protein Chr  42.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4830  phosphocarrier protein Chr  42.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4845  phosphocarrier protein Chr  42.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5313  phosphocarrier protein Chr  42.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4845  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.41 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.778236  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0876  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.29 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.45631  normal  0.298141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5686  phosphocarrier protein Chr  42.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5381  phosphocarrier protein Chr  42.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2036  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.67189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5237  phosphocarrier protein Chr  42.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2146  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.58 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  35.63 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1549  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.66 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000108973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0397  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.081426  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  39.74 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  35.37 
 
 
89 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2967  phosphocarrier protein Chr  32.56 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000334349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4069  phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.486642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3959  phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.130103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3790  phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.190201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3805  phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4268  phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1080  phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  32.93 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  37.8 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4158  phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00355795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12750  Phosphocarrier NPr protein  35.63 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1223  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.24 
 
 
93 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  normal  0.126513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004157  phosphocarrier protein of PTS system  32.56 
 
 
85 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000110743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4094  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.14 
 
 
89 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0707453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2230  HPrNtr  33.73 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0643  phosphocarrier protein HPr  36.84 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.958845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1780  phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0365608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0419  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.21 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  36.59 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>