105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2216 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2216  phosphocarrier, HPr family  100 
 
 
86 aa  163  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.081711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0753  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  70.59 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0187  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  69.41 
 
 
85 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0079  phosphotransferase system, HPr  69.41 
 
 
85 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0088  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  69.41 
 
 
85 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0069  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  69.41 
 
 
85 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0093  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  64.71 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4853  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  67.44 
 
 
86 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3185  HPr family phosphocarrier protein  62.35 
 
 
85 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0997198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0067  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.47 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.933007  normal  0.510342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16870  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  63.53 
 
 
85 aa  86.7  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.288242  normal  0.471923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1539  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.33 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00351141  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4007  HPr family phosphocarrier protein  52.69 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28580  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  48.31 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00406387  normal  0.0448712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4227  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.57 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07040  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  47.19 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0524  phosphocarrier, HPr family  47.83 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8115  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2174  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339455  hitchhiker  0.00100115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0298  HPr family phosphocarrier protein  44.57 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1050  phosphocarrier, HPr family  45.98 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15370  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  47.13 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363386  normal  0.66532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03520  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  40.45 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.58475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4027  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.37 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0620705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  36.47 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2146  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.22 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1429  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  46.27 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0876  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.53 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.45631  normal  0.298141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5261  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.52 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1889  HPr family phosphocarrier protein  38.64 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0357203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7069  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  44.29 
 
 
691 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0643  phosphocarrier protein HPr  39.74 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.958845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4845  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.76 
 
 
96 aa  50.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.778236  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1269  phosphocarrier, HPr family  39.47 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.034972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2878  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1641  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  29.07 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2214  HPr family phosphocarrier protein  40 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5267  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.16 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3201  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.51 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4547  phosphocarrier protein NPr  35.29 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2487  phosphoryl transfer system, HPr  39.19 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.685989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29360  Phosphocarrier protein HPr/PTS system IIA component  36.47 
 
 
231 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.521811  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.34 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  32.88 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1780  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0365608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1951  phosphoryl transfer system HPr  41.54 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000513673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  33.33 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  31.4 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0069  phosphocarrier protein HPr  37.14 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1735  HPrNtr domain-containing protein  37.5 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3878  phosphocarrier protein HPr  38.18 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.050969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4116  phosphocarrier protein HPr  36.36 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  32.93 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2683  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  36.84 
 
 
377 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000835895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1524  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  36.84 
 
 
377 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0548137  normal  0.157237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2764  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  36.84 
 
 
377 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000581833  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.23 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4180  phosphocarrier protein HPr  36.36 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  35.82 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4094  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  29.41 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0707453  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  40 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0331  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.82 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3661  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase component of N-regulated PTS system (Npr)  30.59 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0913  phosphocarrier protein HPr  35.82 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2151  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.44 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1156  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  40 
 
 
237 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.51 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3959  phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.130103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3790  phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.190201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3805  phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4268  phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0485  phosphotransferase system, HPr  33.33 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.467636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1923  HPr family phosphocarrier protein  30.95 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1641  phosphocarrier protein (Hpr)  30.95 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2748  phosphocarrier protein HPr  34.55 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  27.38 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4158  phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00355795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1080  phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4069  phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.486642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3819  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase component of N-regulated PTS system (Npr)  29.41 
 
 
90 aa  42.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2173  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  31.4 
 
 
835 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1786  phosphocarrier protein HPr  36.92 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2036  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.82 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.67189  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1549  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.71 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000108973  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  33.78 
 
 
88 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  26.44 
 
 
89 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12750  Phosphocarrier NPr protein  28.74 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1738  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0669  phosphocarrier protein HPr  29.33 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.829245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2648  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  37.21 
 
 
958 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  27.59 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2307  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0458616  normal  0.112243 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl565  phosphotransferase system phosphohistidine-containing protein  32.84 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217901  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0103  phosphocarrier protein HPr  32.84 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0536118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3315  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.57 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.297486  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1143  phosphocarrier protein HPr  29.85 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.716406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1165  phosphocarrier protein HPr  29.85 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388376  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1243  phosphocarrier protein HPr  36.36 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.691712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3771  HPr family phosphocarrier protein  38.55 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4827  phosphocarrier, HPr family  40.3 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>