43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3028 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  100 
 
 		 396 aa  778    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  45.32 
 
 		 475 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  36.02 
 
 		 695 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  46.61 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  41.51 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  38.01 
 
 		 928 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  41.54 
 
 		 967 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  43.1 
 
 		 654 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  43.83 
 
 		 664 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  32.7 
 
 		 780 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  34.49 
 
 		 1040 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.52 
 
 		 846 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  35.21 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  44.1 
 
 		 546 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  45.78 
 
 		 407 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.29 
 
 		 892 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  47.01 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  33.14 
 
 		 595 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  29.58 
 
 		 617 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  29 
 
 		 867 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.65 
 
 		 879 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  30.12 
 
 		 708 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  48.45 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  37.04 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  24.85 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  37.06 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  29.39 
 
 		 754 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  29.39 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  29.39 
 
 		 705 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  40.86 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  42.06 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  41.49 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  38.33 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  38.02 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  43.59 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  43.59 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  43.59 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  38.3 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  33.97 
 
 		 205 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  26.39 
 
 		 699 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  29.32 
 
 		 662 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2545  hypothetical protein  29.37 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>