More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1052 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
325 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  76 
 
 
325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.08 
 
 
325 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.6 
 
 
326 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.98 
 
 
322 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  69.85 
 
 
325 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.74 
 
 
322 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.34 
 
 
324 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.17 
 
 
326 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.68 
 
 
326 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.03 
 
 
327 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.75 
 
 
324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.63 
 
 
326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.94 
 
 
326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.34 
 
 
327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.33 
 
 
326 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.66 
 
 
347 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.5 
 
 
327 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.28 
 
 
326 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.94 
 
 
334 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.81 
 
 
326 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.51 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.09 
 
 
323 aa  434  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.42 
 
 
326 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2708  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64 
 
 
327 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.11 
 
 
326 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.25 
 
 
324 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.72 
 
 
325 aa  428  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.2 
 
 
326 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.58 
 
 
326 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.26 
 
 
326 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.26 
 
 
326 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.26 
 
 
326 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.06 
 
 
325 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.96 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.75 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.01 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  61.44 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  56.23 
 
 
337 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.31 
 
 
316 aa  376  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
323 aa  359  4e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.89 
 
 
314 aa  332  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
316 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
315 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.38 
 
 
327 aa  317  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
317 aa  316  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.08 
 
 
317 aa  315  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.63 
 
 
316 aa  315  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.75 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
313 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.37 
 
 
315 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.52 
 
 
321 aa  310  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
316 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
322 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.32 
 
 
331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
314 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.79 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  47.76 
 
 
317 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
313 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.54 
 
 
312 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.42 
 
 
316 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
321 aa  300  3e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
338 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
311 aa  299  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.1 
 
 
316 aa  298  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  50.49 
 
 
312 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.5 
 
 
314 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.08 
 
 
314 aa  296  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.98 
 
 
338 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
314 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
330 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.16 
 
 
329 aa  295  6e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
321 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.54 
 
 
318 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.54 
 
 
318 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.57 
 
 
314 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
321 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.74 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 
330 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
321 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.09 
 
 
331 aa  292  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.54 
 
 
312 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.79 
 
 
310 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>