15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0084 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  56.98 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  33.72 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 144 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  33.94 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  32.72 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  31.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1722  endoribonuclease L-PSP  25.45 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  43.94 
 
 		 116 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  29.34 
 
 		 165 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5320  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  27.83 
 
 		 122 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>