25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0410 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  100 
 
 
160 aa  319  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  43.21 
 
 
162 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  43.21 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  45.26 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  41.26 
 
 
162 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  36.53 
 
 
177 aa  97.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0056  hypothetical protein  40.74 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  29.68 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  31.65 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  32.93 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  31.71 
 
 
178 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 
187 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  32.7 
 
 
179 aa  47.4  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  29.03 
 
 
187 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  26.95 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  29.52 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  29.25 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  31.97 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  31.97 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  31.97 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  29.27 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  27.39 
 
 
183 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  27.45 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  27.45 
 
 
186 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  28.74 
 
 
194 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>