31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0064 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59858e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0010  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  100 
 
 		 480 bp  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00119077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0004  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0658061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1265  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0405383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0072  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0637954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0343  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00912352  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.785527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.517191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1751  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.921389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0065  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>