More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01420 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  239  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  80.49 
 
 		 123 aa  193  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  75.21 
 
 		 124 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  77.97 
 
 		 122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  77.97 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  76.42 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  74.8 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 123 aa  183  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 123 aa  182  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  70.73 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  73.73 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  70.73 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  71.54 
 
 		 123 aa  178  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  72.03 
 
 		 122 aa  176  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  71.9 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  72.03 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  72.88 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  73.73 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  72.65 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  72.65 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  72.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  70.34 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  71.19 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  69.49 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  71.54 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  71.93 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  71.19 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  67.8 
 
 		 126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  74.36 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  67.8 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  67.8 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  71.93 
 
 		 121 aa  170  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  67.8 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  73.68 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  70.34 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  67.8 
 
 		 122 aa  168  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  68.38 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  69.37 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  68.38 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  67.8 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  68.38 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  66.38 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  62.6 
 
 		 123 aa  163  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3294  30S ribosomal protein S13  69.57 
 
 		 121 aa  163  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  69.23 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3157  30S ribosomal protein S13  68.7 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  69.23 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  69.83 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  67.52 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  64.96 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0272  30S ribosomal protein S13  65.52 
 
 		 121 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0236994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  66.95 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0350  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3470  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.879267  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2736  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0371  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0299  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0085038  normal  0.0728223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 120 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0290  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  68.7 
 
 		 127 aa  160  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 118 aa  160  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  68.07 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 121 aa  160  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 123 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 122 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  64.41 
 
 		 126 aa  159  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 118 aa  159  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  62.93 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  63.87 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  67.52 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  66.67 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>