More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4075 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.64 
 
 
478 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.08 
 
 
478 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  100 
 
 
512 aa  1058    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  66.26 
 
 
475 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  67.08 
 
 
476 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.24 
 
 
476 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.64 
 
 
478 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  65.64 
 
 
475 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  64.56 
 
 
483 aa  625  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  63.69 
 
 
485 aa  622  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.3 
 
 
496 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  64.21 
 
 
478 aa  611  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.72 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.82 
 
 
498 aa  611  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.27 
 
 
485 aa  604  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  61.68 
 
 
484 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.06 
 
 
491 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.47 
 
 
491 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.06 
 
 
491 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.48 
 
 
485 aa  594  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.78 
 
 
476 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.74 
 
 
490 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.17 
 
 
493 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.35 
 
 
491 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  60.39 
 
 
495 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  61.13 
 
 
489 aa  581  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.17 
 
 
489 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.37 
 
 
489 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.17 
 
 
489 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.76 
 
 
486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.36 
 
 
495 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.48 
 
 
485 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  60.53 
 
 
488 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
471 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.92 
 
 
479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.48 
 
 
486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.12 
 
 
471 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.71 
 
 
471 aa  558  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59 
 
 
494 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  60.32 
 
 
498 aa  557  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59 
 
 
492 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.76 
 
 
519 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.53 
 
 
469 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  57.09 
 
 
481 aa  554  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  58.56 
 
 
506 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.69 
 
 
472 aa  553  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.86 
 
 
472 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.45 
 
 
512 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.1 
 
 
473 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.51 
 
 
474 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.69 
 
 
471 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.44 
 
 
480 aa  547  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.74 
 
 
464 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.7 
 
 
487 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.62 
 
 
472 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.04 
 
 
480 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.52 
 
 
476 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.39 
 
 
471 aa  542  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.27 
 
 
476 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.62 
 
 
473 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.4 
 
 
473 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.87 
 
 
472 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.51 
 
 
471 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.03 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.16 
 
 
471 aa  541  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.95 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.84 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.95 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.2 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.59 
 
 
468 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.72 
 
 
479 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.95 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.49 
 
 
471 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.95 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.24 
 
 
470 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.29 
 
 
472 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.06 
 
 
473 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.29 
 
 
472 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.95 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.95 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.86 
 
 
469 aa  539  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.29 
 
 
472 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.8 
 
 
466 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.1 
 
 
480 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.95 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.08 
 
 
477 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.38 
 
 
468 aa  538  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.81 
 
 
472 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.27 
 
 
467 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.38 
 
 
468 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.82 
 
 
472 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.23 
 
 
468 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.84 
 
 
476 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.09 
 
 
472 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.69 
 
 
472 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
481 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.35 
 
 
477 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.32 
 
 
481 aa  531  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.84 
 
 
479 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>