28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2817 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  94.79 
 
 
307 aa  605  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  94.46 
 
 
307 aa  604  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  94.79 
 
 
307 aa  604  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  94.14 
 
 
307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  93.81 
 
 
307 aa  598  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  94.46 
 
 
307 aa  599  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  84.36 
 
 
307 aa  551  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  84.69 
 
 
307 aa  551  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  84.97 
 
 
307 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  80 
 
 
300 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  59.66 
 
 
319 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  58.62 
 
 
320 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  58.97 
 
 
318 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  42.32 
 
 
342 aa  255  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  41.75 
 
 
348 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  39 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  37.87 
 
 
307 aa  205  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  39.87 
 
 
299 aa  205  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3913  putative cytoplasmic protein  28.94 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00327469  normal  0.242388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  29.9 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  44.05 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  39.51 
 
 
231 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  22.34 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  22.03 
 
 
232 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  24.72 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  37.21 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>