More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1452 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  66.95 
 
 		 242 aa  338  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  66.38 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  64.02 
 
 		 245 aa  325  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  62.66 
 
 		 246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  60 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  61.47 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  61.9 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  61.04 
 
 		 243 aa  304  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  60 
 
 		 242 aa  304  8.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  62.55 
 
 		 239 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.58 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  60.78 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  60.09 
 
 		 245 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  59.74 
 
 		 240 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  60.78 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  60.09 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  59.23 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  59.31 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  58.8 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  58.8 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  58.82 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  58.44 
 
 		 240 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  58.82 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  57.63 
 
 		 247 aa  289  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.87 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  58.19 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  56.6 
 
 		 238 aa  288  4e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  56.78 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  58.65 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  56.78 
 
 		 246 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  57.32 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  56.49 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  58.37 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  56.54 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  57.14 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  56.9 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  57.33 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  55.79 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  58.05 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.33 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  55.17 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  55.83 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  55.42 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  55.6 
 
 		 234 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  54.74 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  54.66 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  55.27 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  54.32 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  52.99 
 
 		 235 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  59.05 
 
 		 253 aa  278  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  55.6 
 
 		 242 aa  279  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  52.7 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  53.11 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  54.85 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  55.56 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  54.58 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  52.7 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  54.94 
 
 		 237 aa  278  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  52.07 
 
 		 245 aa  278  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  53.88 
 
 		 234 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  54.66 
 
 		 241 aa  277  9e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  53.19 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  52.05 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  53.19 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  52.79 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  52.05 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  52.05 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  52.05 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  53.78 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  55.32 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  53.94 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  56.17 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  53.94 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  54.55 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  52.28 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  52.28 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  51.64 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  55.27 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  53.65 
 
 		 235 aa  276  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  54.89 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  53.53 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  55.74 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  53.45 
 
 		 234 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  54.66 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  54.85 
 
 		 239 aa  275  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  54.51 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  55.13 
 
 		 239 aa  274  7e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  53.31 
 
 		 245 aa  274  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  55.7 
 
 		 249 aa  274  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  53.33 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  54.31 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>