32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0255 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  100 
 
 
130 aa  253  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  70.63 
 
 
127 aa  186  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  62.6 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  58.78 
 
 
134 aa  157  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  60.53 
 
 
135 aa  147  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  41.41 
 
 
132 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  44.8 
 
 
139 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  41.94 
 
 
135 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  44.54 
 
 
131 aa  111  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  39.06 
 
 
129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  42.31 
 
 
135 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  41.94 
 
 
132 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  39.5 
 
 
118 aa  101  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  39.52 
 
 
143 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  38.58 
 
 
129 aa  99  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  40.48 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  38.46 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  40.91 
 
 
131 aa  90.5  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  45.05 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  38.46 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  37.3 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  37.23 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  35.04 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  44.21 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  34.75 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  34.07 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  41.84 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  33.91 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  33.06 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  31.97 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  30.65 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  30.83 
 
 
245 aa  57.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>