28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2964 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  343  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  41.48 
 
 
178 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  40.98 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  47.62 
 
 
593 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  53.25 
 
 
615 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  47.37 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  51.39 
 
 
351 aa  64.3  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  49.3 
 
 
299 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  43.06 
 
 
377 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 
437 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  45.33 
 
 
377 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  46.58 
 
 
389 aa  60.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
464 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  43.24 
 
 
378 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  41.41 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 
435 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
476 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  45.71 
 
 
334 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  34.23 
 
 
319 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  40.51 
 
 
379 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  39.77 
 
 
241 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
620 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 
482 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
492 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  45 
 
 
87 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
464 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
634 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>