66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1183 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
1061 aa  2149    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.37 
 
 
773 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.86 
 
 
432 aa  243  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.89 
 
 
440 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.42 
 
 
446 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.3 
 
 
428 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  30.9 
 
 
606 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  30.5 
 
 
403 aa  141  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.78 
 
 
628 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  30 
 
 
439 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.2 
 
 
632 aa  138  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.03 
 
 
626 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.64 
 
 
378 aa  112  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.08 
 
 
824 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.45 
 
 
2182 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.84 
 
 
1034 aa  94.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.61 
 
 
1034 aa  93.2  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  34.43 
 
 
2831 aa  91.3  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  26.36 
 
 
1170 aa  79.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.3 
 
 
1074 aa  79.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.68 
 
 
1501 aa  78.2  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  24.39 
 
 
429 aa  71.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.08 
 
 
889 aa  68.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.45 
 
 
999 aa  67.8  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.88 
 
 
2171 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.37 
 
 
997 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  27.87 
 
 
507 aa  66.6  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.26 
 
 
457 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.33 
 
 
557 aa  66.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  38.61 
 
 
1378 aa  65.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.98 
 
 
563 aa  64.7  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.23 
 
 
1217 aa  61.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.86 
 
 
821 aa  60.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  28.91 
 
 
586 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  28.37 
 
 
815 aa  58.9  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.08 
 
 
379 aa  57.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  33.33 
 
 
3089 aa  57  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.71 
 
 
553 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.74 
 
 
406 aa  55.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  28.65 
 
 
2961 aa  55.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  30.52 
 
 
1321 aa  55.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  23.34 
 
 
502 aa  55.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.77 
 
 
559 aa  54.7  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.06 
 
 
344 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.59 
 
 
1286 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.92 
 
 
1283 aa  54.3  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.98 
 
 
1212 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  26.59 
 
 
423 aa  52.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.26 
 
 
557 aa  52.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.24 
 
 
414 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.24 
 
 
414 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.24 
 
 
414 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.2 
 
 
561 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2270  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.67 
 
 
748 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000172268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.44 
 
 
986 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.82 
 
 
1035 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  26.24 
 
 
344 aa  48.5  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.74 
 
 
1292 aa  48.1  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 
763 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  26.24 
 
 
344 aa  48.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  25.1 
 
 
365 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1269  hypothetical protein  33.6 
 
 
1141 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  29.7 
 
 
1099 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  28.82 
 
 
1116 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  26.42 
 
 
1109 aa  45.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>