42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1715 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  25.41 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  25.82 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  24.32 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  24.86 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  26.24 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2696  regulator of competence-specific genes  31.65 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  29.22 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  30.52 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  31.08 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  31.08 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  31.08 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  25.89 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1124  TfoX family protein  26.06 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000094765  normal  0.380229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00970  hypothetical protein  26.06 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000688807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2159  TfoX family protein  26.06 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000143241  normal  0.451422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00963  hypothetical protein  26.06 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000316322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1068  TfoX family protein  26.06 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2684  regulator of competence-specific genes  26.06 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1075  TfoX family protein  26.06 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000055454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2637  regulator of competence-specific genes  26.06 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00582565  hitchhiker  0.000000482749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  26.76 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000187987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  24.52 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  24.03 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  26.39 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  26.39 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  26.39 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  26.39 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  26.39 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  28.97 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  27.06 
 
 		 133 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  25.3 
 
 		 168 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  28.21 
 
 		 120 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  24.14 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  29.63 
 
 		 108 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  27.16 
 
 		 120 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2355  TfoX family protein  38.1 
 
 		 114 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000106232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  24.1 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  21.05 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  25.93 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  24.69 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  21.25 
 
 		 126 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>