More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0828 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  66.14 
 
 
264 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  66.14 
 
 
264 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  66.14 
 
 
264 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  66.14 
 
 
264 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  65.75 
 
 
264 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  66.14 
 
 
264 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  65.35 
 
 
264 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  64.57 
 
 
263 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  64.17 
 
 
263 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  64.17 
 
 
264 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  63.39 
 
 
264 aa  358  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  63.39 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0526  methionine aminopeptidase  62.99 
 
 
264 aa  353  1e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
264 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
260 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
261 aa  322  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
261 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  58.37 
 
 
263 aa  319  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  59.45 
 
 
261 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  55.69 
 
 
261 aa  318  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
271 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  58.66 
 
 
260 aa  316  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  57.87 
 
 
260 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  57.42 
 
 
267 aa  315  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
271 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
271 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
271 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
271 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
271 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
271 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  58 
 
 
262 aa  314  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
271 aa  314  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  58.27 
 
 
256 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  57.59 
 
 
270 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  58.82 
 
 
271 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
259 aa  311  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  56.69 
 
 
259 aa  311  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  58.98 
 
 
270 aa  310  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  55.25 
 
 
258 aa  310  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  57.37 
 
 
264 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  58.43 
 
 
269 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  58.04 
 
 
271 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  58.98 
 
 
258 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  58.04 
 
 
271 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  58.04 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  59.06 
 
 
254 aa  308  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  58.04 
 
 
271 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  58.04 
 
 
269 aa  308  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  56.97 
 
 
264 aa  309  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  59.06 
 
 
254 aa  308  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  57.48 
 
 
258 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  56.49 
 
 
260 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  57.43 
 
 
261 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  58.17 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  56.69 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  59.27 
 
 
263 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0562  methionine aminopeptidase, type I  55.81 
 
 
263 aa  305  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  55.3 
 
 
264 aa  306  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  55.95 
 
 
263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 
263 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
260 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 
258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  57.03 
 
 
261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  57.72 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  55.56 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  55.91 
 
 
260 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  54.3 
 
 
275 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  56.47 
 
 
267 aa  301  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  55.82 
 
 
261 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  55.56 
 
 
270 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  56.68 
 
 
268 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 
266 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  54.44 
 
 
268 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  53.33 
 
 
269 aa  298  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  56.28 
 
 
268 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  54.05 
 
 
268 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  54.05 
 
 
268 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  54.72 
 
 
266 aa  297  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  52.82 
 
 
280 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  53.97 
 
 
255 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 
275 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  55.38 
 
 
269 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  55.38 
 
 
269 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 
268 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  57.39 
 
 
261 aa  292  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  57.39 
 
 
261 aa  292  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>