44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4324 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  100 
 
 
620 aa  1254    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  50.25 
 
 
624 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  35.93 
 
 
637 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  34.76 
 
 
641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  34.76 
 
 
641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  34.6 
 
 
641 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  33.79 
 
 
648 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  33.44 
 
 
653 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  36.48 
 
 
639 aa  323  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
669 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  35.35 
 
 
723 aa  313  7.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
671 aa  312  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  32.94 
 
 
674 aa  310  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  34.34 
 
 
659 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  33.23 
 
 
651 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  33.55 
 
 
659 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  31.95 
 
 
658 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  34 
 
 
656 aa  279  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  30.85 
 
 
650 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  33.39 
 
 
678 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  31.76 
 
 
570 aa  150  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  22 
 
 
621 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  21.79 
 
 
592 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  21.96 
 
 
592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  21.63 
 
 
592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  22.99 
 
 
635 aa  84  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
455 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.32 
 
 
754 aa  81.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  24.55 
 
 
300 aa  62  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 
303 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 
282 aa  48.5  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
297 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  30.13 
 
 
337 aa  47.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.78 
 
 
322 aa  47.4  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  21.4 
 
 
304 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.89 
 
 
344 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
304 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  21.89 
 
 
314 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
341 aa  44.3  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  24.89 
 
 
283 aa  44.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
330 aa  44.3  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>