75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3675 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3675  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 143 aa  283  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.709341  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  43.06 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 		 176 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.17 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0159  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  38.93 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  30.77 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  36.17 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  32.08 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 1370 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2056  anti-sigma regulatory factor  28.15 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.773482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2079  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000225228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  30.43 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0417  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456804  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0408  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  30.53 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  34.04 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  41.07 
 
 		 434 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  29.03 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  29.03 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  32.26 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  27.07 
 
 		 250 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  32.98 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  32.98 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  32.98 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4818  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  32.26 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  32.26 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  22.22 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3443  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  29.36 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0106512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1493  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2838  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0253  putative signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00246404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2936  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 725 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0663  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  28.36 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00575622  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  34.18 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0326  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  28.46 
 
 		 148 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.91 
 
 		 616 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0401  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.67 
 
 		 144 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.36 
 
 		 655 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.84 
 
 		 792 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 250 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 640 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0066  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 132 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>