More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2053 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 271 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  56.2 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  56.45 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  56.05 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  48.8 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  52.57 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  52.4 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  49.02 
 
 		 262 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  48.99 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  46.44 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  56.28 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  49.43 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  54.69 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2071  6-phosphogluconolactonase  55.38 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  49.03 
 
 		 494 aa  188  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  52 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  49.8 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  47.33 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  47.33 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  47.33 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  50.6 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2092  6-phosphogluconolactonase  46.47 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  45.16 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  49 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  46.18 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  53.72 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  53.64 
 
 		 447 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2257  6-phosphogluconolactonase  45.34 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  52.4 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2526  6-phosphogluconolactonase  45.06 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  47.56 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1553  6-phosphogluconolactonase  49.19 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  42.8 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2370  6-phosphogluconolactonase  43.57 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  42.48 
 
 		 571 aa  138  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  35.02 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  36.03 
 
 		 245 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  35.34 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  40.28 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  32.41 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  38.24 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  38.1 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  36.96 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  31.71 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  37.8 
 
 		 228 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  34.27 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  37.8 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  35.6 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  31.02 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  35.66 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  41.58 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  30.57 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  28.77 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  29.1 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  29.8 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  36.76 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  31.17 
 
 		 240 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  31.45 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  34.85 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  32.7 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  35.2 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  29.37 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  28.46 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  35.43 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  34.69 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  29.41 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  34.94 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  28.34 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  36.52 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  44 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  29.18 
 
 		 235 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  36.13 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  38.16 
 
 		 239 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  42.21 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  28.69 
 
 		 238 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  36.92 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13160  6-phosphogluconolactonase  35.09 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  30.96 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  27.64 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  29.55 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  32.38 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  31.84 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1021  6-phosphogluconolactonase  35.32 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  34.51 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  40.53 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.98 
 
 		 237 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  25.11 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  31.8 
 
 		 237 aa  92.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1023  6-phosphogluconolactonase  34.44 
 
 		 242 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.725443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  30.24 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  40 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.731811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>