34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0881 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  82.29 
 
 		 271 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  63.97 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  58.21 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  53.82 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  36.13 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  27.44 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1175  hypothetical protein  24.51 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  27.5 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  24.69 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  24.64 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  23.75 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  27.5 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  24.79 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  25.82 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  29.25 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  23.64 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  29.65 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  26.91 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  23.76 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  27.61 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  23.76 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  23.95 
 
 		 611 aa  58.9  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  22.22 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  23.71 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  23.23 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  21.11 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  22.61 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  22.22 
 
 		 515 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  22.32 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  20.1 
 
 		 438 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0833  hypothetical protein  34.78 
 
 		 500 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0409042 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  28 
 
 		 485 aa  42.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>