37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0570 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  77.14 
 
 		 354 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  87.77 
 
 		 345 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  40.56 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  44.63 
 
 		 367 aa  268  8e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  45.71 
 
 		 356 aa  268  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  45.77 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  41.82 
 
 		 360 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  40.52 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  43.79 
 
 		 368 aa  256  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  45.26 
 
 		 363 aa  255  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  42.55 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  42.94 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  43.33 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  45.35 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  44.15 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  39.68 
 
 		 369 aa  232  7.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  39.64 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  38.57 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  38.1 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  38.75 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  32.34 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  34.66 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  41.11 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  45.19 
 
 		 171 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  32.43 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  32.19 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  30.82 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  30.87 
 
 		 159 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  31.16 
 
 		 157 aa  52.8  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  34.44 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  27.93 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.28 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  32.65 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  32.5 
 
 		 455 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.57 
 
 		 216 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  30.43 
 
 		 151 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>